Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 253 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDND1Q9NY35 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDND1Q9NY35 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
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