Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
DNAJC28Q9NX36 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DNAJC28Q9NX36 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DNAJC28Q9NX36 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DNAJC28Q9NX36 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DNAJC28Q9NX36 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DNAJC28Q9NX36 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DNAJC28Q9NX36 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DNAJC28Q9NX36 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms