Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNTG1Q9NSN8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTG1Q9NSN8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms