Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMSN1Q9NSI8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMSN1Q9NSI8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms