Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms