Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAB6BQ9NRW1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms