Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNX15Q9NRS6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX15Q9NRS6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX15Q9NRS6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX15Q9NRS6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX15Q9NRS6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SNX15Q9NRS6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX15Q9NRS6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX15Q9NRS6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX15Q9NRS6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX15Q9NRS6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX15Q9NRS6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX15Q9NRS6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX15Q9NRS6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX15Q9NRS6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX15Q9NRS6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX15Q9NRS6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX15Q9NRS6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX15Q9NRS6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX15Q9NRS6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX15Q9NRS6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX15Q9NRS6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX15Q9NRS6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SNX15Q9NRS6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX15Q9NRS6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX15Q9NRS6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX15Q9NRS6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SNX15Q9NRS6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms