Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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CNGB3Q9NQW8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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CNGB3Q9NQW8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CNGB3Q9NQW8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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CNGB3Q9NQW8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGB3Q9NQW8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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