Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYLDQ9NQC7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms