Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KIAA1549Q9HCM3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KIAA1549Q9HCM3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KIAA1549Q9HCM3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KIAA1549Q9HCM3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KIAA1549Q9HCM3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
KIAA1549Q9HCM3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KIAA1549Q9HCM3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KIAA1549Q9HCM3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms