Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PLXNA4Q9HCM2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms