Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CBX8Q9HC52 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms