Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6Y2

WDR55, WD repeat-containing protein 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR55Q9H6Y2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR55Q9H6Y2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR55Q9H6Y2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR55Q9H6Y2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR55Q9H6Y2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WDR55Q9H6Y2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
WDR55Q9H6Y2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
WDR55Q9H6Y2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
WDR55Q9H6Y2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms