Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIM5Q9C035 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms