Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ROPN1BQ9BZX4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms