Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZD4

NUF2, Kinetochore protein Nuf2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUF2Q9BZD4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NUF2Q9BZD4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NUF2Q9BZD4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms