Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY5

CAPS2, Calcyphosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPS2Q9BXY5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAPS2Q9BXY5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPS2Q9BXY5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPS2Q9BXY5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPS2Q9BXY5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPS2Q9BXY5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CAPS2Q9BXY5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms