Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MAP1LC3CQ9BXW4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms