Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LSM14BQ9BX40 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LSM14BQ9BX40 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms