Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC94Q9BW85 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC94Q9BW85 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms