Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TINF2Q9BSI4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TINF2Q9BSI4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms