Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP8

PYM1, Partner of Y14 and mago, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYM1Q9BRP8 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PYM1Q9BRP8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms