Protein–RNA interactions for Protein: Q99865

SPIN2A, Spindlin-2A, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2AQ99865 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SPIN2AQ99865 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SPIN2AQ99865 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms