Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MEIS3Q99687 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MEIS3Q99687 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms