Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHP1Q99653 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHP1Q99653 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms