Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POP1Q99575 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POP1Q99575 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POP1Q99575 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POP1Q99575 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POP1Q99575 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POP1Q99575 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POP1Q99575 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POP1Q99575 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POP1Q99575 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POP1Q99575 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POP1Q99575 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POP1Q99575 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POP1Q99575 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POP1Q99575 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POP1Q99575 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POP1Q99575 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POP1Q99575 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POP1Q99575 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POP1Q99575 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POP1Q99575 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POP1Q99575 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POP1Q99575 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POP1Q99575 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POP1Q99575 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POP1Q99575 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POP1Q99575 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POP1Q99575 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POP1Q99575 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POP1Q99575 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POP1Q99575 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POP1Q99575 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POP1Q99575 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POP1Q99575 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POP1Q99575 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POP1Q99575 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POP1Q99575 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POP1Q99575 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POP1Q99575 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POP1Q99575 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POP1Q99575 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POP1Q99575 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POP1Q99575 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POP1Q99575 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POP1Q99575 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POP1Q99575 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POP1Q99575 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POP1Q99575 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POP1Q99575 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POP1Q99575 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POP1Q99575 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POP1Q99575 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POP1Q99575 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POP1Q99575 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POP1Q99575 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POP1Q99575 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POP1Q99575 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POP1Q99575 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POP1Q99575 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POP1Q99575 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POP1Q99575 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POP1Q99575 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POP1Q99575 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POP1Q99575 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
POP1Q99575 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POP1Q99575 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POP1Q99575 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POP1Q99575 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POP1Q99575 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POP1Q99575 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POP1Q99575 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POP1Q99575 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POP1Q99575 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POP1Q99575 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POP1Q99575 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POP1Q99575 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POP1Q99575 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POP1Q99575 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POP1Q99575 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POP1Q99575 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POP1Q99575 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POP1Q99575 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POP1Q99575 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POP1Q99575 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POP1Q99575 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POP1Q99575 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POP1Q99575 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POP1Q99575 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POP1Q99575 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POP1Q99575 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POP1Q99575 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POP1Q99575 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
POP1Q99575 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
POP1Q99575 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POP1Q99575 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POP1Q99575 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POP1Q99575 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POP1Q99575 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POP1Q99575 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POP1Q99575 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms