Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EYA3Q99504 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EYA3Q99504 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms