Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NAP1L3Q99457 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms