Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MYCBPQ99417 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MYCBPQ99417 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms