Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CRBNQ96SW2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms