Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRNT1Q96Q11 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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