Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAMD11Q96NU1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms