Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PCMTD1Q96MG8 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCMTD1Q96MG8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms