Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SENP8Q96LD8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms