Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
COG3Q96JB2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COG3Q96JB2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms