Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC34Q96HJ3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC34Q96HJ3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms