Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ATG4CQ96DT6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ATG4CQ96DT6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms