Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMEM54Q969K7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMEM54Q969K7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms