Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BHMTQ93088 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BHMTQ93088 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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