Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HERVK_113Q902F9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HERVK_113Q902F9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms