Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU0

DDI1, Protein DDI1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI1Q8WTU0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DDI1Q8WTU0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDI1Q8WTU0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDI1Q8WTU0 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDI1Q8WTU0 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
DDI1Q8WTU0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDI1Q8WTU0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDI1Q8WTU0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDI1Q8WTU0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDI1Q8WTU0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DDI1Q8WTU0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DDI1Q8WTU0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms