Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBA3Q8TBC4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBA3Q8TBC4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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