Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHDC9Q8NEP7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHDC9Q8NEP7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms