Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZIC4Q8N9L1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms