Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CCDC155Q8N6L0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC155Q8N6L0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms