Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MSL3Q8N5Y2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MSL3Q8N5Y2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms