Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SMIM20Q8N5G0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SMIM20Q8N5G0 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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