Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LMNTD2Q8IXW0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LMNTD2Q8IXW0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms