Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT6

LRRC8A, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8AQ8IWT6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC8AQ8IWT6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC8AQ8IWT6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC8AQ8IWT6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC8AQ8IWT6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC8AQ8IWT6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC8AQ8IWT6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC8AQ8IWT6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC8AQ8IWT6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC8AQ8IWT6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC8AQ8IWT6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC8AQ8IWT6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC8AQ8IWT6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC8AQ8IWT6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC8AQ8IWT6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC8AQ8IWT6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC8AQ8IWT6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC8AQ8IWT6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC8AQ8IWT6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC8AQ8IWT6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC8AQ8IWT6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC8AQ8IWT6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC8AQ8IWT6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC8AQ8IWT6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC8AQ8IWT6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC8AQ8IWT6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC8AQ8IWT6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC8AQ8IWT6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC8AQ8IWT6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms