Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC3FQ8IUX4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
APOBEC3FQ8IUX4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms